Enzymkommissionsnummer - Enzyme Commission number

Nicht zu verwechseln mit der Nummer der Europäischen Gemeinschaft .

Die Enzymkommissionsnummer ( EG-Nummer ) ist ein numerisches Klassifizierungsschema für Enzyme , basierend auf den chemischen Reaktionen, die sie katalysieren . Als System der Enzymnomenklatur ist jeder EC-Nummer ein empfohlener Name für die entsprechende enzymkatalysierte Reaktion zugeordnet.

EC-Nummern spezifizieren keine Enzyme, sondern enzymkatalysierte Reaktionen. Wenn verschiedene Enzyme (zB von verschiedenen Organismen) dieselbe Reaktion katalysieren, erhalten sie dieselbe EC-Nummer. Darüber hinaus können durch konvergente Evolution völlig unterschiedliche Proteinfaltungen eine identische Reaktion katalysieren (diese werden manchmal als nicht-homologe isofunktionelle Enzyme bezeichnet ) und würden daher die gleiche EC-Nummer erhalten. Im Gegensatz dazu spezifizieren UniProt- Identifikatoren ein Protein eindeutig durch seine Aminosäuresequenz.

Zahlenformat

Jeder Enzymcode besteht aus den Buchstaben "EC", gefolgt von vier durch Punkte getrennten Zahlen. Diese Zahlen repräsentieren eine zunehmend feinere Klassifizierung des Enzyms. Vorläufige EC-Nummern existieren und haben ein 'n' als Teil der vierten (Serien-)Ziffer (zB EC 3.5.1.n3).

Beispielsweise haben die Tripeptid-Aminopeptidasen den Code „EC 3.4.11.4“, dessen Bestandteile auf folgende Enzymgruppen hinweisen:

Top-Level-Codes

EC-Nummern der obersten Ebene
Klasse Reaktionskatalysiert Typische Reaktion Enzymbeispiel(e) mit Trivialnamen
EC 1
Oxidoreduktasen

Oxidations- /Reduktionsreaktionen; Übertragung von H- und O-Atomen oder Elektronen von einer Substanz auf eine andere

AH + B → A + BH ( reduziert )
A + O → AO ( oxidiert ) 		Dehydrogenase , Oxidase
EC 2
Transferasen 		Übertragung einer funktionellen Gruppe von einem Stoff auf einen anderen. Die Gruppe kann eine Methyl-, Acyl-, Amino- oder Phosphatgruppe sein AB + C → A + BC Transaminase , Kinase
EC 3
Hydrolasen 		Bildung von zwei Produkten aus einem Substrat durch Hydrolyse AB + H 2 O → AOH + BH Lipase , Amylase , Peptidase , Phosphatase
EC 4
Lyasen 		Nichthydrolytische Addition oder Entfernung von Gruppen von Substraten. CC-, CN-, CO- oder CS-Bindungen können gespalten werden RCOCOOH → RCOH + CO 2 oder [X-A+BY] → [A=B + XY] Decarboxylase
EC 5
Isomerasen 		Intramolekulare Umlagerung, dh Isomerisierungsänderungen innerhalb eines einzelnen Moleküls ABC → BCA Isomerase , Mutase
EM 6
Ligasen 		Verbinden zweier Moleküle durch Synthese neuer CO-, CS-, CN- oder CC- Bindungen mit gleichzeitigem Abbau von ATP X + Y + ATP → XY + ADP + P i Synthetase
EC 7
Translocases 		Katalysieren Sie die Bewegung von Ionen oder Molekülen durch Membranen oder deren Trennung innerhalb von Membranen Transporter

Reaktionsähnlichkeit

Ähnlichkeiten zwischen enzymatischen Reaktionen können mithilfe von Bindungsänderungen, Reaktionszentren oder Substrukturmetriken (früher EC-BLAST], jetzt EMBL-EBI Enzyme Portal) berechnet werden.

Geschichte

Vor der Entwicklung des EC-Zahlensystems wurden Enzyme willkürlich benannt, und Namen wie altes gelbes Enzym und Äpfelsäure-Enzym , die wenig oder keinen Hinweis darauf geben, welche Reaktion katalysiert wurde, waren gebräuchlich. Die meisten dieser Namen sind in Vergessenheit geraten, obwohl einige wenige, insbesondere proteolytische Enzyme mit sehr geringer Spezifität, wie Pepsin und Papain , immer noch verwendet werden, da eine rationale Klassifizierung auf der Grundlage der Spezifität sehr schwierig war.

In den 1950er Jahren wurde das Chaos unerträglich, und nachdem Hoffman-Ostenhof und Dixon und Webb ähnliche Schemata zur Klassifizierung enzymkatalysierter Reaktionen vorgeschlagen hatten, richtete der Internationale Kongress für Biochemie in Brüssel die Enzymkommission unter dem Vorsitz von Malcolm Dixon ein 1955. Die erste Version wurde 1961 veröffentlicht, und die Enzymkommission wurde damals aufgelöst, obwohl ihr Name in der Bezeichnung EC-Nummer weiterlebt . Die aktuelle sechste Auflage, die 1992 von der International Union of Biochemistry and Molecular Biology als letzte gedruckte Version herausgegeben wurde, enthält 3196 verschiedene Enzyme. Die Beilagen 1-4 wurden 1993-1999 veröffentlicht. Nachfolgende Ergänzungen wurden elektronisch auf der Website des Nomenklaturkomitees der International Union of Biochemistry and Molecular Biology veröffentlicht. Im August 2018 hat die IUBMB das System modifiziert, indem sie die Top-Level-Kategorie EC 7 mit Translokasen hinzugefügt hat.

Siehe auch

Verweise

Externe Links