Helen M. Berman - Helen M. Berman

Helen Berman
Helen Berman im Jahr 2008.
Helen Berman im Jahr 2008.
Geboren
Helen Miriam Berman

1943 (77–78 Jahre)
Chicago, Illinois
Alma Mater
Ehepartner
Kinder Jason Asher Young
Auszeichnungen
Wissenschaftliche Karriere
Felder
Institutionen Rutgers Universität
These Die Kristallstrukturen von Alpha Prime und Beta-D-Mannit, Galacticol, Methyl-Aalpha-D-Glucopyranosid und Hydroxyharnstoff   (1967)
Doktorvater George A. Jeffrey
Andere akademische Berater Barbara Low , Jenny Glusker
Webseite rutchem .rutgers .edu / berman-helen-m

Helen Miriam Berman ist Professorin für Chemie und chemische Biologie an der Rutgers University und ehemalige Direktorin der RCSB-Proteindatenbank (einer der Mitgliedsorganisationen der weltweiten Proteindatenbank ). Ihre Arbeit als Strukturbiologin umfasst die Strukturanalyse von Protein-Nukleinsäure-Komplexen und die Rolle von Wasser bei molekularen Wechselwirkungen. Sie ist außerdem Gründerin und Direktorin der Nucleic Acid Database und leitete die Protein Structure Initiative Structural Genomics Knowledgebase.

Hintergrund und Ausbildung

Berman wurde in Chicago, Illinois, geboren und wuchs in Brooklyn, New York, auf. Ihr Vater, David Bernstein, war Arzt und ihre Mutter, Dorothy Bernstein (geb. Skupsky), leitete die Büropraxis ihres Vaters. Inspiriert von ihrem fleißigen und gelehrten Vater interessierte sie sich als junges Mädchen für Naturwissenschaften und plante, Wissenschaftlerin oder Ärztin zu werden. Ihre Mutter, die stark in der Gemeinde und in der Freiwilligenarbeit engagiert war, beeinflusste sie, ihr ganzes Leben lang an Aktivitäten in der Gemeinde beteiligt zu sein.

Während der High School arbeitete Berman in Ingrith Deyrups Labor am Barnard College . Deyrup ermutigte Berman, Barnard als Student zu besuchen. Während ihres Studiums arbeitete sie mit Barbara Low in einem Labor des Columbia University College für Ärzte und Chirurgen . Dort lernte Berman die Kristallographie kennen , die zu einer lebenslangen Leidenschaft werden sollte. Sie schloss Barnard 1964 mit einem AB in Chemie ab.

Nach dem College besuchte Berman die University of Pittsburgh für eine Graduiertenschule, einen Ort, den sie ausgewählt hatte, weil er der einzige Ort im Land mit einer Abteilung für Kristallographie war und einer der wenigen, an denen Kristallographie als Fach angeboten wurde. Dort arbeitete sie mit George A. Jeffrey an der Kohlenhydratstruktur und promovierte zum Dr. 1967 blieb Berman zwei weitere Jahre als Postdoktorand an der Universität von Pittsburgh .

Werdegang

1969 zog Berman an das Fox Chase Cancer Center in Philadelphia, wo sie im Labor von Jenny P. Glusker arbeitete , bevor sie 1973 ihr eigenes unabhängiges Forschungsprogramm als Fakultätsmitglied startete. Bei Fox Chase interessierte sich Berman für Nukleinsäurestrukturen und in der Bioinformatik. Sie wusste, dass eine logische Organisation von Daten für eine Vielzahl von Wissenschaftlern nützlich sein würde.

Im Juni 1971 nahm Berman an einem Symposium im Cold Spring Harbor Laboratory teil , bei dem sich mehrere Wissenschaftler darauf einigten, dass Daten über die wachsende Anzahl von Proteinstrukturen in einer Datenbank archiviert werden sollten. Dieses Treffen führte zur Schaffung der Proteindatenbank (PDB) im Brookhaven National Laboratory .

1989 zog Berman nach Rutgers und 1992 gründete sie zusammen mit anderen Wissenschaftlern die Nucleic Acid Database (NDB), um Informationen über die Nucleinsäurestruktur zu sammeln und zu verbreiten. Bei Rutgers untersuchte sie weiterhin Nukleinsäuren und ihre Wechselwirkungen mit Proteinen und untersuchte in Zusammenarbeit mit Barbara Brodsky und Jordi Bella die Struktur von Kollagen . Sie ist von 1992 bis 2011 als Ablagererin auf 38 Strukturen in der PDB von Protein / Nukleinsäure-Komplexen und ihren Komponenten (z. B. 1RUN, 3SSX, 2B1B), Kollagenfragmenten (z. B. 1CGD, 1EI8) und anderen Makromolekülen aufgeführt.

1998 bewarben sich Berman und Philip Bourne gemeinsam um die Proteindatenbank und gewannen den Auftrag. Die Datenbank wurde von Brookhaven an die Schirmherrschaft des Forschungskollaboratoriums für strukturelle Bioinformatik (RCSB) verlegt, das derzeit eine Zusammenarbeit zwischen Rutgers und der University of California darstellt. San Diego. Mit Kollegen hat Berman das Datenverwaltungssystem neu gestaltet, neue Benutzerwerkzeuge hinzugefügt und die Datenbank durchsuchbar gemacht. Seit 2003 wird das PDB-Archiv von der weltweiten Proteindatenbank (wwPDB) verwaltet, einer von Berman gegründeten Partnerschaft, die aus Organisationen besteht, die als Ablagerungs-, Datenverarbeitungs- und Verteilungszentren für PDB-Daten fungieren - RCSB, PDBe in Europa, und die PDBj in Japan. 2006 wurde die BioMagResData (BMRB) -Datenbank für Kernspinresonanzstrukturen (NMR) das vierte Mitglied der wwPDB. Ab Juli 2018 besitzt der NDB über 9600 Nukleinsäurestrukturen und der PDB mehr als 142.000 makromolekulare Strukturen.

Ebenfalls vom RCSB geleitet, wurde im Frühjahr 2008 die Strukturgenom- Wissensdatenbank der Proteinstrukturinitiative (PSI) ins Leben gerufen, um ein kontinuierlich aktualisiertes Portal für Forschungsdaten und andere Ressourcen aus den PSI-Bemühungen bereitzustellen.

Berman war auch in der wissenschaftlichen Gemeinschaft aktiv, war 1988 Präsident der American Crystallographic Association, beriet sowohl die National Institutes of Health als auch die National Science Foundation und war Redaktionsmitglied mehrerer Zeitschriften. Ihre Arbeiten wurden in weit veröffentlicht begutachteten wissenschaftlichen Zeitschriften .

Berman war der ausführende Produzent und Schöpfer der Dokumentarserie Target Zero, die sich sowohl mit den medizinischen als auch mit den sozialen Aspekten der HIV-Behandlung und -Vorbeugung befasst. Die drei Kurzfilme verweben reale Patientengeschichten, Interviews mit führenden Ärzten, medizinischen Anbietern und Wissenschaftlern. und hochmoderne molekulare Animationen. Diese Berichte beleuchten die komplexe Geschichte der Bekämpfung der HIV-Epidemie und zeigen den anhaltenden Bedarf an mitfühlender, patientenzentrierter Versorgung und einem echten Verständnis der Wissenschaft hinter den Behandlungen auf zellulärer Ebene.

Ehren und Auszeichnungen

  • New Jersey Woman of Achievement (1993)
  • Fellow der American Association for the Advancement of Science (1996)
  • Auszeichnung für herausragende Wissenschaftlerinnen, Vereinigung für Frauen in der Wissenschaft , New York Chapter (1999)
  • Namhafter Dozent, Sigma Xi : The Scientific Research Society (2007–2009)
  • Distinguished Service Award, Biophysical Society (2000) [1]
  • Fellow, Biophysical Society (2001)
  • MJ Buerger Award, American Crystallographic Association (2006)
  • Alumni-Preis des Department of Chemistry der University of Pittsburgh (2010)
  • Fellow der American Crystallographic Association (2011) [2]
  • Carl Brändén Award der Protein Society (2012)
  • DeLano Award für Computational Biosciences der American Society for Biochemistry and Molecular Biology (2013)
  • Benjamin Franklin Award für Open Access in den Biowissenschaften (2014)

Persönliches Leben

Berman war zweimal verheiratet, in den 1960er Jahren mit dem Ingenieur Victor Berman und von 1976 bis 1999 mit dem Molekularbiologen Peter Young. Aus zweiter Ehe hat sie einen Sohn, Jason Asher Young (geb. 1979), einen Physiker.

In den 1980er Jahren wurde bei Berman Brustkrebs diagnostiziert. Die Erfahrung machte sie fokussierter in ihrem Leben und ihrer Karriere und daran interessiert, andere Frauen zu unterstützen, die vor der gleichen Diagnose stehen.

Verweise