HHV-Kapsidportalprotein - HHV capsid portal protein
| HHV-Kapsidportalprotein | |||||||
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| Kennungen | |||||||
| Organismus | ? | ||||||
| Symbol | UL6 | ||||||
| UniProt | P10190 | ||||||
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HHV-Kapsidportalprotein oder HSV-1 U L -6-Protein ist das Protein, das im Kapsid des Herpes-simplex-Virus (HSV-1) ein zylindrisches Portal bildet . Das Protein wird üblicherweise als HSV-1 U L -6- Protein bezeichnet, da es das Transkriptionsprodukt des Herpes- Gens U L -6 ist.
Die Herpes-Virus- DNA tritt über das Kapsidportal in das Kapsid ein und verlässt es. Das Kapsidportal besteht aus zwölf Kopien eines als Ring angeordneten Portalproteins; Die Proteine enthalten eine Leucin-Zipper- Sequenz von Aminosäuren, die es ihnen ermöglichen, aneinander zu haften. Jedes ikosaedrische Kapsid enthält ein einzelnes Portal, das sich in einem Scheitelpunkt befindet.
Das Portal wird während der anfänglichen Kapsidassemblierung gebildet und interagiert mit Gerüstproteinen , die das Procapsid konstruieren. Wenn das Kapsid fast abgeschlossen ist, tritt die virale DNA , die das Kapsid (dh die DNA wird enkapsidiert ) durch einen Mechanismus , dem Portal und ein DNA-bindendes - Protein - Komplex ähnlich zu denen Bakteriophagen Terminase . Mehrere Studien legen eine evolutionäre Beziehung zwischen Capsid Portal Protein und Bakteriophagen Portal Proteinen nahe.
Wenn ein Virus eine Zelle infiziert, muss die virale DNA aus dem Kapsid freigesetzt werden. Die Herpesvirus-DNA tritt durch das Kapsidportal aus.
Die genetische Sequenz des HSV-1-Gens U L -6 ist in der gesamten Familie der Herpesviridae konserviert, und diese Genfamilie ist als "Herpesvirus UL6-ähnliche" Genfamilie bekannt. "U L -6" ist eine Nomenklatur, die bedeutet, dass das Protein genetisch durch den sechsten (6.) offenen Leserahmen codiert wird, der im viralen Genomsegment mit dem Namen "Unique-Long (U L )" gefunden wird.
Studien
| Untersuchungen nach Aminosäuresequenzort | ||
| pU L -6 Aminosäurebereich | Zusammenfassung | Referenz |
|---|---|---|
| E121, A618, Q621 | Punktmutationen verleihen Resistenz gegen den Portalassemblierungsinhibitor WAY-150138 | van Zeijl et al. 2000 |
| 198-295 | Die Deletionsmutante bildet unreife B-Kapside ohne Portale | Nellissery et al. , 2007 |
| 322-416 | Deletionsmutanten bilden unreife B-Kapside, die Portale enthalten | Nellissery et al. , 2007 |
| 409-473 | ||
| L429, L436 | Mutationsstudien legen nahe, dass ein mutmaßlicher Leucin-Reißverschluss für die Bildung des Portalrings erforderlich ist | Nellissery et al. , 2007 |
| R676 | Carboxyl ( C ) -terminales Ende | NCBI-Sequenz |
| pU L -26,5 "Gerüstprotein" Aminosäurebereich | Zusammenfassung | Referenz |
| 143-151 | Das Löschen verhindert die Montage des U L -6-Portals | Singer et al. , 2005 |
Dodekamerische Struktur
Die 2004 durchgeführten Untersuchungen verwendeten Elektronenmikroskopie, um vorherzusagen, dass U L -6 Polymere mit 11, 12, 13 und 14 Einheiten bildet. Die dodekamerische Form wurde als am wahrscheinlichsten befunden.
Durch Verfeinerungen der Elektronenmikroskopie im Jahr 2007 konnte festgestellt werden, dass das Portal ein Polymer mit zwölf (12) Einheiten ist, das an einem der zwölf Kapsidscheitelpunkte vorhanden ist, anstelle des U L -19-Pentamers, das an Nichtportalscheitelpunkten gefunden wurde.
Der Leucin-Reißverschluss sorgt für eine Adhäsion zwischen Proteinen
Eine Studie unter Verwendung von Deletion und Mutation der U L -6-Aminosäuresequenz zeigte, dass die Leucinreste in einem vorhergesagten Leucin-Zipper-Motiv für die Bildung der dodekamerischen Ringstruktur erforderlich waren.
Frühzeitige Beteiligung an der Kapsidassemblierung
Der Zusammenbau von Portaleinheiten ist ein erster Schritt bei der Konstruktion von Kapsiden viraler Nachkommen. In Abwesenheit von Portalen zusammengebaute Kapside haben keine Portale.
Wechselwirkung mit Kapsidgerüstprotein
Im Jahr 2003 zeigten Gelelektrophoresestudien, dass intakte U L -6-Portale in vitro mit dem viralen Protein U L -26 assoziieren . Diese Assoziation wird durch die Wirkung von WAY-150138, einem Thioharnstoff- Inhibitor der HHV -Einkapselung, antagonisiert .
Weitere Untersuchungen im Jahr 2006 zeigten, dass der Zusammenbau des Kapsids mit dem Portal von der Wechselwirkung von U L -6 mit dem "Gerüst" -Protein U L -26,5, Aminosäuren 143 bis 151, abhängt.
Interaktion mit dem Terminasekomplex
U L -6 assoziiert mit einem U L -15 / U L -28-Proteinkomplex während der Kapsidassemblierung. Es wird angenommen, dass das U L -15 / U L -28 an virale DNA bindet und dem gleichen Zweck wie die Terminase dient, indem virale DNA während des Zusammenbaus des Kapsids in das Kapsid gepackt wird.
Funktion während des DNA-Austritts
Die DNA verlässt das Kapsid in einem einzigen linearen Segment. Der DNA-Austritt kann durch U L -6 gesteuert werden und hängt von der Temperatur oder den Umweltproteinen ab.