Ku80 - Ku80

XRCC5
Verfügbare Strukturen
PDB	Orthologsuche: PDBe RCSB
Liste der PDB-ID-Codes
	1JEQ , 1JEY , 1Q2Z , 1RW2 , 3RZ9
Bezeichner
Aliase	XRCC5 , KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, Röntgenreparatur komplementierend defekte Reparatur in Zellen des Chinesischen Hamsters 5, Röntgenreparatur kreuzkomplementierend 5
Externe IDs	OMIM : 194364 MGI : 104517 Homologene : 40681 Genecards : XRCC5
Genort ( Mensch )
Chr.	Chromosom 2 (Mensch)
Ende	216.206.303 bp
Genort ( Maus )
Chr.	Chromosom 1 (Maus)
Ende	72.394.952 bp
RNA - Expressionsmuster
	; ;
	Weitere Referenzausdrucksdaten
Gen-Ontologie
Molekulare Funktion	• DNA-Bindung ; • Nukleotid-Bindung ; • Doppelstrang-Telomer-DNA-Bindung ; • Telomer-DNA-Bindung ; • GO:0008026 Helikase-Aktivität ; • 5'-Desoxyribose-5-Phosphat-Lyase-Aktivität ; • GO:0004003 DNA-Helikase-Aktivität ; • Hydrolase-Aktivität, auf Säureanhydride wirkend ; • Protein C-Terminus-Bindung ; • GO:0001948 Proteinbindung ; • Hydrolase-Aktivität ; • ATP-Bindung ; • Ubiquitin-Proteinligase-Bindung ; • Doppelstrang-DNA-Bindung ; • beschädigte DNA-Bindung ; • RNA-Bindung ; • GO:0010577 Enzymaktivator-Aktivität ; • GO:0032403 proteinhaltiger Komplex Bindung ; • DNA-Endbindung;
Zelluläre Komponente	• Zytoplasma ; • Zytosol ; • Zellkern-Telomerkappen-Komplex ; • Membran ; • Plasmamembran ; • Nukleoplasma ; • Chromosom ; • Nukleolus ; • Nichthomologer Endverbindungskomplex ; • Nukleus ; • extrazelluläre Region ; • sekretorisches Granulalumen ; • Protein-DNA-Komplex ; • Ku70:Ku80-Komplex ; • Proteinhaltiger Komplex ; • Ort der DNA-Schädigung ; • Ribonukleoprotein-Komplex;
Biologischer Prozess	• DNA-Rekombination ; • Regulation der Transkription, DNA-gesteuert ; • Regulation der Proliferation glatter Muskelzellen ; • Transkription, DNA-gesteuert ; • zelluläre Reaktion auf DNA-Schadensreiz ; • positive Regulation der Neurogenese ; • Differenzierung hämatopoetischer Stammzellen ; • Reparatur von Doppelstrangbrüchen ; • negative Regulation der t-Kreis-Bildung ; • Etablierung einer integrierten proviralen Latenz ; • Zellpopulationsproliferation ; • Negative Regulation der Transkription, DNA-gestützte ; • Positive Regulation der Typ-I-Interferonproduktion ; • Reaktion auf Arzneimittel ; • zelluläre hyperosmotische Salinitätsreaktion ; • DNA-Reparatur ; • DNA-Duplex-Entwindung ; • Gehirn Entwicklung ; • zelluläre Reaktion auf Fettsäure ; • Reparatur von Doppelstrangbrüchen durch nichthomologe Endverbindung ; • Degranulation von Neutrophilen ; • zelluläre Reaktion auf Gammastrahlung ; • zelluläre Reaktion auf Röntgenstrahlen ; • Telomererhaltung ; • Regulierung der Telomererhaltung ; • positive Regulierung der Telomererhaltung durch Telomerase ; • GO:0048554 positive Regulierung des Katalysators Aktivität ; • positive Regulation der Proteinkinaseaktivität ; • positive Regulation der Telomeraseaktivität ; • Proteinlokalisation auf dem Chromosom, Telomerregion ; • zelluläre Reaktion auf den Leukämie-Hemmfaktor ; • Aktivierung der angeborenen Immunantwort ; • Immunsystemprozess ; • angeborene Immunantwort;
	Quellen: Amigo / QuickGO
Orthologe
	7520
	22596
	ENSG00000079246
	ENSMUSG00000026187
	P13010
	P27641
	NM_021141
	NM_009533 ; NM_001357519 ; NM_001357520
	NP_066964
	NP_033559 ; NP_001344448 ; NP_001344449
	Wikidata
Mensch anzeigen/bearbeiten	Maus anzeigen/bearbeiten

Ku80 ist ein Protein , das beim Menschen vom XRCC5- Gen kodiert wird . Gemeinsam Ku70 bilden und Ku80 den Ku - Heterodimer , das bindet an DNA - Doppelstrangbruch Enden und sind für den erforderlichen nicht-homologe Ende Beitritt (NHEJ) Weg der DNA - Reparatur . Es wird auch für die V(D)J-Rekombination benötigt , die den NHEJ-Weg nutzt, um die Antigendiversität im Immunsystem von Säugetieren zu fördern .

Zusätzlich zu seiner Rolle in NHEJ wird Ku für die Aufrechterhaltung der Telomerlänge und die subtelomerische Gen-Stummschaltung benötigt.

Ku wurde ursprünglich identifiziert, als bei Patienten mit systemischem Lupus erythematodes festgestellt wurde, dass sie hohe Mengen an Autoantikörpern gegen das Protein aufwiesen.

Nomenklatur

Ku80 wurde mit mehreren Namen bezeichnet, darunter:

Lupus-Ku-Autoantigenprotein p80
ATP-abhängige DNA-Helikase 2 Untereinheit 2
Röntgenreparatur zur Ergänzung der defekten Reparatur in Zellen des chinesischen Hamsters 5
X-ray Repair Cross-Complementing 5 (XRCC5)

Epigenetische Repression

Das Proteinexpressionsniveau von Ku80 kann durch epigenetische Hypermethylierung der Promotorregion des Gens XRCC5, das Ku80 kodiert, reprimiert werden. In einer Studie mit 87 übereinstimmenden Paaren von Primärtumoren von nicht-kleinzelligem Lungenkarzinom und nahegelegenem normalem Lungengewebe wiesen 25 % der Tumoren einen Verlust der Heterozygotie am XRCC5-Locus auf und ein ähnlicher Prozentsatz von Tumoren hatte eine Hypermethylierung der Promotorregion von XRCC5 . Eine niedrige Proteinexpression von Ku80 war signifikant mit einer niedrigen mRNA-Expression und mit einer XRCC5- Promotor-Hypermethylierung assoziiert, jedoch nicht mit einer LOH des Gens.

Seneszenz

Mausmutanten mit homozygoten Defekten in Ku80 erfahren einen frühen Beginn der Seneszenz . Ku80(-/-)-Mäuse zeigen eine altersbedingte Pathologie (Osteopenie, atrophische Haut, hepatozelluläre Degeneration, hepatozelluläre Einschlüsse, hepatische hyperplastische Herde und altersspezifische Mortalität). Darüber hinaus weisen Ku80(-/-)-Mäuse eine stark reduzierte Lebensdauer und Größe auf. Der Verlust von nur einem einzigen Ku80-Allel bei Ku(-/+)-heterozygoten Mäusen verursacht eine beschleunigte Alterung der Skelettmuskulatur, obwohl das postnatale Wachstum normal ist. Eine Analyse des Ku80-Proteinspiegels bei Mensch, Kuh und Maus zeigte, dass die Ku80-Spiegel zwischen den Spezies dramatisch variieren und dass diese Spiegel stark mit der Langlebigkeit der Spezies korrelieren . Diese Ergebnisse legen nahe, dass der durch Ku80 vermittelte NHEJ-Weg der DNA-Reparatur eine bedeutende Rolle bei der Reparatur von Doppelstrangbrüchen spielt, die ansonsten zu einer frühen Seneszenz führen würden (siehe DNA-Schadenstheorie des Alterns ).

Klinische Bedeutung

Ein seltener Mikrosatelliten- Polymorphismus in diesem Gen wird bei Patienten mit unterschiedlicher Strahlenempfindlichkeit mit Krebs in Verbindung gebracht .

Mangel bei Krebs

Ein Mangel an Expression eines DNA-Reparaturgens erhöht das Krebsrisiko (siehe Mangelhafte DNA-Reparatur bei der Karzinogenese ). Es wurde festgestellt, dass die Expression des Ku80-Proteins beim Melanom mangelhaft ist. Darüber hinaus wurde eine geringe Expression von Ku80 bei 15 % der nicht-kleinzelligen Lungenkarzinome vom Adenokarzinom-Typ und 32 % der nicht-kleinzelligen Lungenkarzinome vom Plattenepithel-Typ gefunden , und dies korrelierte mit einer Hypermethylierung des XRCC5- Promotors.

Ku80 scheint eines von 26 verschiedenen DNA-Reparaturproteinen zu sein, die bei verschiedenen Krebsarten epigenetisch reprimiert werden (siehe Krebsepigenetik ).

Interaktionen

Es wurde gezeigt, dass Ku80 interagiert mit:

Verweise

Weiterlesen

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Externe Links

PDBe-KB bietet einen Überblick über alle Strukturinformationen, die in der PDB für das kreuzkomplementierende Protein 5 . für die Human-Röntgenreparatur verfügbar sind

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